Высшим органом управления Гимназии является учредитель: автономная некоммерческая организация высшего образования "Московский международный университет".
Управление текущим учебно-консультационным процессом и оперативной деятельностью Гимназии осуществляет Директор, назначаемый учредителем.
Директор является единоличным исполнительным органом Гимназии и осуществляет текущее руководство деятельностью Гимназии.
Управление Гимназией осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности. В Гимназии сформированы следующие коллегиальные органы управления:
- Общее собрание работников Гимназии;
- Педагогический совет Гимназии.